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曙光服务器承载云南大学高性能计算中心
 
慧聪网   2005年11月25日8时46分   信息来源:计世网    

  近日,为了解决各学科对大型、密集、高性能计算的迫切需求,云南大学投资500万元成立了高性能计算中心。该中心采用了曙光4000A机群服务器,计算规模达3840 亿次每秒,在最近公布的2005年中国高性能计算机性能TOP 100排行榜中,排第89位。该中心的成立能实现高速网络环境下多种计算资源的有效聚合和充分共享,为材料、信息、数理化、生命和大气科学等学科研究提供高性能计算服务,支持云南省重要领域的大型计算软件研制,并逐步形成多学科交叉和创新研究的平台。

  云南大学是云南省唯一一所实施国家“211工程”的地方综合性大学和国家西部重点支持高校和省部共建高校,学校学科门类齐全、人才密集,已成为西南边疆高层次人才培养基地和高水平科学研究基地。云大高性能计算中心部署的曙光4000A机群服务器系统由二十多个并行计算节点、I/O节点和管理登录节点构成。计算节点采用基于AMD Opteron处理器的曙光R2480A四路服务器,I/O节点和管理登录节点均采用曙光R220A双路服务器。该系统部署了高速计算网、千兆存储接入网和百兆管理监控网等3套网络,能在提高整体系统性能的同时提供更高的稳定性和可靠性。

  据悉,目前该系统已经与云大校园网连通,用户可以通过网络远程登陆并提交相关计算作业。在此前试运行的生命科学、大气分析研究二个应用中,曙光机群满负荷运转,96个CPU使用率接近100%,极好地实现了预期目标,得到了用户的认可。云大生命科学院生物资源保护与利用重点实验室使用 Gromacs分子动力学模拟软件从事 HIV 病毒 gp120 糖蛋白分子动力学模拟实验,以往1ns 蛋白质结构模拟在单机上需运行一星期,而目前在采用 24 个节点,每节点 1CPU 的条件下仅需计算 13 小时。资源环境与地球科学学院大气数值模拟实验室使用该系统从事黑炭气溶胶辐射气候效应的数值试验,通过使用区域气候模式 Regcm3 模式对 2001-2002 年 BC 气候效应进行数值模拟,以往在普通 PC 单机运行需 96 小时,而在机群系统单节点仅需 48 小时。

  随着机群技术的日渐成熟,基于CLUSTER架构的机群服务器开始在教育城域网、高校信息化和教育科研网格建设中得到用户的青睐。在西部四十多所高校校园网,北京、烟台、上海、南阳等地城域网以及中山大学、北京邮电大学等重点高校的教育科研网格项目中,曙光TC1700、曙光3000以及最新一代的曙光4000系列机群服务器实现了广泛部署。

 
 
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