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宝德力助华南理工大学高性能计算系统
2006年6月27日 8:50  来源:慧聪教育装备网

    华南理工大学是直属教育部的全国重点大学,校内设有中国教育和科研计算机网华南网络中心、广东省教育和科研计算机网络中心。学校治学严谨,形成了"团结、勤奋、求实、创新"的优良校风,在华南理工引入高性能计算,有助于推进新的科研项目,提供数据论据。

    华南理工大学高性能计算系统是将为教学科研的大型科学问题等进行并行计算和深度计算而需要建立的,属于计算密集型高性能计算项目,对研究方向所涉及的大规模高复杂性系统模型验证算法、大规模数据处理与服务等问题的研究提供有效的支撑平台,对在整个实验室运转过程中的各种高性能与大容量应用要求和服务提供支撑平台,对LINKPACK值LINKPACK效率等要求达到最好。

    项目目标切实实现高性能并行计算应用分析

    高性能并行计算的应用软件位于高性能计算生态系统的最上层,针对不同的行业有专业的产品,针对各个领域的科学与工程计算应用,直接为用户创造价值。这些软件原来大多运行在大型主机上,是面向多个处理器、多进程、多任务的单节点软件,进程之间的通信通过大型主机操作系统的消息机制进行,消息机制的启动通过函数进行调用。

    本系统中,应用软件面向教学和科研应用领域的多个方面基于多节点IA架构系统,进程或任务之间的通信,基于多节点集群的中间件提供的并行通信库MPI,物理层是基于标准互联以太网系统。并行库的启动,通过特定的程序语句进行调用。

    高性能应用软件总体概括分类:

    √多媒体运算主要使用整型和双精度运算。包括图形图像处理和三维图像生成的高性能计算系统,强调计算节点的多媒体计算功能。计算科学院的大气科学和流体力学应用中需要的许多模拟仿真计算都属于这类计算。

    √科学计算主要使用浮点运算功能,这也是目前高性能计算系统的最主要应用领域。比如:高分子运动分析、石油勘测分析等。计算科学院的大气科学、固体力学、分子力学、流体力学、有限元分析等的主体计算都属于这类计算,这类计算需要系统具有强大的浮点运算能力。本项目的计算属于此类应用。

    √数据库应用主要使用逻辑计算和I/O操作。包括数据库集群系统和网格数据库系统的应用。强调计算节点有很强的I/O处理能力,同时,整个高性能计算系统具有足够的外接存储空间。本系统结合此类应用,奠定未来网格计算的基础。

    INTEL和宝德技术人员针对华南理工的项目特点和目标,投入极高的专注和热情,在华南理工项目前期进行了详细的测试分析,提出系统优化和移植的策略,帮助客户将微分方程数值计算并行模拟器勘测系统移植到IA平台上。

    Intel还提供了系列的优化工具、编译工具、集群工具等众多高性能计算组件和虚拟技术,为IA架构、标准互联的高性能计算系统应用提供高效率的保证,成为本次HPC项目成功实施的关键。

    解决方案

    近年来,高教体系的专项科研项目依托国家863计划,气象建模、模拟撞车试验、人类基因组图谱绘制以及模拟核爆炸等各种与人类生命息息相关的重要领域都要用到HPC。

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