| 2009年中国大学排行榜前1-20名 | 2009年中国大学排行榜前21-50名 |
| 2009年中国大学排行榜第51-75名 | 2009年中国大学排行榜第76-100名 |
| 21 | 中国人民大学 | 56.67 | 25.47 | 14.50 | 10.97 | 31.19 | 0.71 | 30.48 | 京 | 4 | 综合 | 文科类 | 研究2型 |
| 22 | 北京航空航天大学 | 54.51 | 24.64 | 15.71 | 8.93 | 29.87 | 27.65 | 2.22 | 京 | 5 | 理工 | 工学类 | 研究2型 |
| 23 | 厦门大学 | 53.01 | 24.59 | 15.91 | 8.68 | 28.41 | 15.78 | 12.63 | 闽 | 1 | 综合 | 文理类 | 研究2型 |
| 24 | 大连理工大学 | 47.67 | 22.75 | 14.23 | 8.52 | 24.92 | 23.41 | 1.50 | 辽 | 1 | 理工 | 工学类 | 研究2型 |
| 25 | 同济大学 | 45.93 | 22.81 | 12.30 | 10.51 | 23.11 | 20.85 | 2.27 | 沪 | 3 | 理工 | 工学类 | 研究2型 |
| 26 | 华南理工大学 | 45.74 | 20.31 | 13.04 | 7.27 | 25.43 | 23.80 | 1.63 | 粤 | 2 | 理工 | 工学类 | 研究2型 |
| 27 | 重庆大学 | 41.81 | 23.09 | 9.80 | 13.29 | 18.73 | 15.03 | 3.70 | 渝 | 1 | 综合 | 文理类 | 研究2型 |
| 28 | 兰州大学 | 41.78 | 20.08 | 11.96 | 8.12 | 21.70 | 18.69 | 3.01 | 甘 | 1 | 综合 | 理学类 | 研究2型 |
| 29 | 西北工业大学 | 40.49 | 18.80 | 12.19 | 6.61 | 21.69 | 20.74 | 0.95 | 陕 | 2 | 理工 | 工学类 | 研究2型 |
| 30 | 华东师范大学 | 40.42 | 18.74 | 10.94 | 7.80 | 21.69 | 9.98 | 11.71 | 沪 | 4 | 师范 | 文理类 | 研究2型 |
| 31 | 北京理工大学 | 39.10 | 18.89 | 11.26 | 7.64 | 20.21 | 18.57 | 1.64 | 京 | 6 | 理工 | 工学类 | 研究2型 |
| 32 | 中国农业大学 | 38.75 | 15.89 | 9.49 | 6.40 | 22.86 | 21.20 | 1.66 | 京 | 7 | 农林 | 理科类 | 研究2型 |
| 33 | 湖南大学 | 35.32 | 16.74 | 9.32 | 7.42 | 18.58 | 14.87 | 3.72 | 湘 | 2 | 综合 | 综合类 | 研究2型 |
| 34 | 东北大学 | 32.41 | 17.41 | 7.99 | 9.42 | 15.00 | 12.87 | 2.13 | 辽 | 2 | 理工 | 工学类 | 研究2型 |
| 35 | 郑州大学 | 31.17 | 20.63 | 5.06 | 15.57 | 10.54 | 8.35 | 2.20 | 豫 | 1 | 综合 | 综合类 | 研教2型 |
| 36 | 南京航空航天大学 | 31.04 | 16.07 | 8.10 | 7.97 | 14.97 | 13.64 | 1.33 | 苏 | 3 | 理工 | 工学类 | 研究2型 |
| 37 | 华东理工大学 | 31.01 | 15.21 | 9.40 | 5.81 | 15.80 | 15.10 | 0.70 | 沪 | 5 | 理工 | 理科类 | 研究2型 |
| 38 | 苏州大学 | 30.92 | 16.01 | 7.32 | 8.69 | 14.92 | 10.27 | 4.65 | 苏 | 4 | 综合 | 综合类 | 研教1型 |
| 39 | 南京农业大学 | 30.84 | 14.42 | 6.95 | 7.47 | 16.42 | 14.05 | 2.37 | 苏 | 5 | 农林 | 文理类 | 研究2型 |
| 40 | 武汉理工大学 | 29.27 | 17.89 | 6.29 | 11.60 | 11.38 | 9.98 | 1.40 | 鄂 | 3 | 理工 | 工学类 | 研教2型 |
| 41 | 上海大学 | 28.55 | 15.66 | 7.78 | 7.88 | 12.89 | 9.73 | 3.16 | 沪 | 6 | 综合 | 综合类 | 研教1型 |
| 42 | 北京科技大学 | 28.46 | 14.55 | 8.01 | 6.54 | 13.91 | 13.37 | 0.55 | 京 | 8 | 理工 | 工学类 | 研教1型 |
| 43 | 电子科技大学 | 27.97 | 14.40 | 7.71 | 6.69 | 13.56 | 12.28 | 1.29 | 川 | 2 | 理工 | 理科类 | 研教2型 |
| 44 | 西南大学 | 27.89 | 15.52 | 5.42 | 10.10 | 12.37 | 7.38 | 4.99 | 渝 | 2 | 综合 | 文理类 | 研教2型 |
| 45 | 东北师范大学 | 25.31 | 11.98 | 7.28 | 4.70 | 13.33 | 9.06 | 4.27 | 吉 | 2 | 师范 | 文理类 | 研教1型 |
| 46 | 西安电子科技大学 | 24.93 | 12.95 | 6.34 | 6.61 | 11.98 | 11.51 | 0.46 | 陕 | 3 | 理工 | 理科类 | 研教2型 |
| 47 | 西北农林科技大学 | 24.44 | 12.26 | 4.80 | 7.46 | 12.19 | 11.52 | 0.67 | 陕 | 4 | 农林 | 理科类 | 研教2型 |
| 48 | 暨南大学 | 24.25 | 10.56 | 6.30 | 4.27 | 13.69 | 6.71 | 6.98 | 粤 | 3 | 综合 | 综合类 | 研教1型 |
| 49 | 南京理工大学 | 24.18 | 12.48 | 6.07 | 6.41 | 11.70 | 10.79 | 0.91 | 苏 | 6 | 理工 | 工学类 | 研教1型 |
| 50 | 华中师范大学 | 24.00 | 10.88 | 6.38 | 4.50 | 13.13 | 5.02 | 8.10 | 鄂 | 4 | 师范 | 文理类 | 研教1型 |